2009年，經(jīng)國家教育部批準(zhǔn)，清華大學(xué)整合醫(yī)學(xué)、生物、工程、化學(xué)等多學(xué)科優(yōu)勢，設(shè)立藥學(xué)本科學(xué)位授予點(diǎn)，并在此基礎(chǔ)上招收“醫(yī)學(xué)藥學(xué)實(shí)驗(yàn)班”，旨在培養(yǎng)藥學(xué)領(lǐng)域高端人才，滿足國家戰(zhàn)略需求；2012年1月，經(jīng)校務(wù)會議討論，決定成立清華大學(xué)藥學(xué)系，英文名稱Department of Pharmacology and Pharmaceutical Sciences，并于同年11月舉辦了建系儀式，由劉剛教授擔(dān)任系主任；為更好地滿足藥學(xué)學(xué)科發(fā)展需求，為早日實(shí)現(xiàn)建設(shè)世界一流、一流前列、頂尖大學(xué)的目標(biāo)同步貢獻(xiàn)力量，經(jīng)校務(wù)會議討論，決定成立清華大學(xué)藥學(xué)院，英文名稱School of Pharmaceutical Sciences，英文縮寫SPS。2015年12月25日，藥學(xué)院正式成立。2015年12月至2022年6月，由丁勝教授擔(dān)任首任院長；2022年7月起，由錢鋒教授擔(dān)任院長。

清華大學(xué)藥學(xué)院建院時(shí)間雖短，但高屋建瓴，面向國家重大戰(zhàn)略需求，充分利用后發(fā)優(yōu)勢，定位轉(zhuǎn)化特色，圍繞藥學(xué)關(guān)鍵生物問題、藥學(xué)關(guān)鍵技術(shù)研究以及疾病研究與靶向治療三個(gè)方向，開展隊(duì)伍建設(shè)、人才培養(yǎng)、科學(xué)研究、平臺建設(shè)、對外合作等工作，藥學(xué)學(xué)科建設(shè)取得長足進(jìn)步，創(chuàng)新能力全面提升、重大成果持續(xù)涌現(xiàn)。

隊(duì)伍建設(shè)方面，藥學(xué)院共有在職教師38人，其中教研系列33人、教學(xué)系列1人、研究系列4人。近80%教研系列教師入選國家高層次人才項(xiàng)目、國家高層次人才青年項(xiàng)目，形成由戰(zhàn)略科學(xué)家、一流科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才、卓越青年人才組成的人才梯隊(duì)，成為最堅(jiān)定的隊(duì)伍核心。另，學(xué)院有在站博士后82人，作為科研骨干，成為最堅(jiān)實(shí)的隊(duì)伍支撐。

人才培養(yǎng)方面，藥學(xué)院目前全日制在讀學(xué)生共計(jì)376人，其中本科生100人、碩士研究生2人、博士研究生274人。清華大學(xué)藥學(xué)院每年通過全國高考以及清華大學(xué)強(qiáng)基計(jì)劃擇優(yōu)錄取本科生，同時(shí)通過本、外校推薦免試以及全國統(tǒng)招的方式擇優(yōu)錄取研究生，生源優(yōu)秀。2022年7月，藥學(xué)一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)正式設(shè)立，標(biāo)志著清華大學(xué)形成藥學(xué)本、碩、博一體化教育教學(xué)體系，人才培養(yǎng)邁入新的歷史階段。

科學(xué)研究方面，藥學(xué)院充分發(fā)揮了基礎(chǔ)研究的主力軍和重大科技突破的策源地作用，不斷強(qiáng)化藥學(xué)基礎(chǔ)研究，持續(xù)攻堅(jiān)藥學(xué)關(guān)鍵核心技術(shù)、加速應(yīng)用新興科技，突破成果轉(zhuǎn)化瓶頸。眾多原始創(chuàng)新、核心技術(shù)積累，已顯示出強(qiáng)大的應(yīng)用價(jià)值，有望短期內(nèi)實(shí)現(xiàn)有組織的、建制化的、規(guī)模化的藥學(xué)創(chuàng)新成果轉(zhuǎn)化，抓住歷史機(jī)遇，在邁進(jìn)制藥強(qiáng)國征程中，乘勢而上，進(jìn)一步強(qiáng)化引領(lǐng)作用，提升國際影響力和競爭力。

平臺建設(shè)方面，藥學(xué)院致力于構(gòu)建可推進(jìn)高效、系統(tǒng)化轉(zhuǎn)化的共享平臺。已建平臺包括新靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)子平臺、高通量篩選子平臺、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)子平臺、藥物制劑子平臺等。目前已面向校內(nèi)及校外高校與研究所，開放了首個(gè)由專業(yè)團(tuán)隊(duì)管理和運(yùn)營的，以藥物發(fā)現(xiàn)、篩選和評價(jià)為核心的公共服務(wù)平臺——藥學(xué)技術(shù)中心，成為藥物研究與發(fā)現(xiàn)的重要支撐。

對外合作方面，藥學(xué)院始終以開放的姿態(tài)，探索多元聯(lián)動合作模式。與美國、澳洲等地在內(nèi)的高校、研究所、企業(yè)保持著多種模式的人才培養(yǎng)合作；與包括先聲藥業(yè)、渤健、強(qiáng)生、拜耳、百時(shí)美施貴寶等在內(nèi)的國內(nèi)外行業(yè)頂尖企業(yè)保持著科學(xué)研究、成果轉(zhuǎn)化等各方面多形式的深度互動。

立足“兩個(gè)大局”、心懷“國之大者”、把高質(zhì)量發(fā)展貫穿在各項(xiàng)工作之中，是清華大學(xué)的時(shí)代選擇。高質(zhì)量發(fā)展藥學(xué)學(xué)科，是清華大學(xué)藥學(xué)院的使命。藥學(xué)院將圍繞“高質(zhì)量”，繼續(xù)堅(jiān)定發(fā)展。期望到2030年，在服務(wù)國家戰(zhàn)略能力上更加突出，在國際學(xué)術(shù)領(lǐng)域的地位和影響力顯著提升，治理體系更加成熟完善，形成具有中國特色、清華風(fēng)格的藥學(xué)學(xué)科體系，聯(lián)動健康學(xué)科群交叉融合，推動醫(yī)藥創(chuàng)新高地建設(shè)，為制藥強(qiáng)國戰(zhàn)略、人類健康共同體建設(shè)貢獻(xiàn)清華智慧。