最新研究成果 | 清華大學(xué)藥學(xué)院肖百龍教授課題組、生命學(xué)院李雪明研究員課題組與藥學(xué)院田博學(xué)研究員課題組合作解析機(jī)械力受體PIEZO1的結(jié)構(gòu)功能機(jī)制


最新研究成果


2024年12月23日,清華大學(xué)藥學(xué)院肖百龍教授課題組、生命學(xué)院李雪明研究員課題組與藥學(xué)院田博學(xué)研究員課題組合作,在神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域權(quán)威期刊《神經(jīng)元》(Neuron)雜志在線發(fā)表了題為《中間開放態(tài)結(jié)構(gòu)揭示機(jī)械激活PIEZO1 通道的門控轉(zhuǎn)換》(An intermediate open structure reveals the gating transition of the mechanically activated PIEZO1 channel)的研究長(zhǎng)文,解析了機(jī)械力受體PIEZO1的中間開放狀態(tài)的結(jié)構(gòu),揭示了其精細(xì)結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)變化和門控轉(zhuǎn)換過程,并結(jié)合結(jié)構(gòu)分析、分子動(dòng)力學(xué)模擬和電生理實(shí)驗(yàn),定義了其關(guān)閉態(tài)、開放態(tài)和失活態(tài)的不同構(gòu)象狀態(tài),提出了其門控循環(huán)機(jī)制,完善了其曲率感知理論學(xué)說。

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PIEZO是一類專門的機(jī)械力受體,具有將多種形式的機(jī)械刺激轉(zhuǎn)導(dǎo)成陽離子內(nèi)流的能力。PIEZO蛋白憑借其納米尺度的曲率形變,能夠感受皮牛尺度的力,并在毫秒尺度被激活,隨后快速失活。這種出色的機(jī)械敏感性使得PIEZO蛋白在多種細(xì)胞中發(fā)揮重要的機(jī)械信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)功能,進(jìn)而調(diào)控了觸覺、本體感覺、機(jī)械痛癢覺、血壓、心率和性快感等眾多生理過程。PIEZO蛋白在受力時(shí)可以從關(guān)閉狀態(tài)迅速轉(zhuǎn)換至開放狀態(tài),隨后快速進(jìn)入失活狀態(tài)。PIEZO蛋白的精細(xì)門控調(diào)節(jié)可能對(duì)應(yīng)著其發(fā)揮的廣泛生理和病理作用。例如:在體內(nèi)一些細(xì)胞類型中,內(nèi)源的PIEZO1介導(dǎo)電流的失活速度相較于異源表達(dá)的PIEZO1顯著減慢;PIEZO1的一些功能獲得性突變的人類致病位點(diǎn)往往具有電流失活變慢的特點(diǎn)。因此,確定PIEZO不同功能狀態(tài)的結(jié)構(gòu)對(duì)于在分子層面上深入理解其門控過程至關(guān)重要。

肖百龍團(tuán)隊(duì)和李雪明團(tuán)隊(duì)先前的研究揭示了PIEZO蛋白以同源三聚體的形式組成三葉螺旋槳樣結(jié)構(gòu),帶有帽子結(jié)構(gòu)(Cap)的離子孔道位于三聚體中央。在先前使用去垢劑解析的PIEZO1結(jié)構(gòu)中,三個(gè)槳葉(Blade)高度彎曲成碗狀,稱之為“納米碗”,此時(shí)帽子結(jié)構(gòu)處于向上位置且帽子門(Cap-gate)關(guān)閉,與帽子門相連的彈簧連接器(Spring-linker)處于放松狀態(tài),離子孔道的疏水跨膜孔徑較小且被認(rèn)為處于關(guān)閉狀態(tài),無法浸潤(rùn)和滲透離子,細(xì)胞內(nèi)側(cè)的杠桿結(jié)構(gòu)(Beam)沒有彎折,側(cè)向門塞(Lateral plug)也被堵塞。這類彎曲的構(gòu)象有可能代表PIEZO1的關(guān)閉構(gòu)象(圖1上) (Nature 2018, Nature 2019, Neuron 2020)。

在利用脂質(zhì)體-膜蛋白重組體系,引入由質(zhì)膜與重組蛋白曲率差異而產(chǎn)生的作用力后,研究者進(jìn)一步解析出了PIEZO1蛋白的受力展平構(gòu)象,此時(shí)槳葉完全被壓平,同時(shí)帽子結(jié)構(gòu)處于向上位置且帽子門關(guān)閉,彈簧連接器處于放松狀態(tài),跨膜孔道部分?jǐn)U張,細(xì)胞內(nèi)側(cè)的杠桿結(jié)構(gòu)彎折,側(cè)向門塞處于堵塞狀態(tài)。鑒于此結(jié)構(gòu)下PIEZO1蛋白持續(xù)受力,因此該展平構(gòu)象很可能處于失活狀態(tài)(圖1下)(Nature 2022)。

PIEZO通道毫秒尺度的動(dòng)力學(xué)特征使其難以穩(wěn)定在開放狀態(tài),因此對(duì)于解析其開放狀態(tài)結(jié)構(gòu)帶來了非常大的挑戰(zhàn)。本研究首先鑒定到一個(gè)位于離子孔道疏水跨膜區(qū)的點(diǎn)突變PIEZO1-S2472E,其電生理特性表現(xiàn)出更高的自發(fā)開放電流和更慢的電流失活速度,提示PIEZO1-S2472E突變體可能通過減緩PIEZO1向失活狀態(tài)的轉(zhuǎn)變而穩(wěn)定在開放狀態(tài)。研究者克服了PIEZO1-S2472E蛋白純化得率低的難題,使用冷凍電鏡解析出其三類構(gòu)象狀態(tài)的結(jié)構(gòu):第一類構(gòu)象與PIEZO1彎曲結(jié)構(gòu)類似,被稱為S2472E-Curved;第二類構(gòu)象的槳葉區(qū)高度介于彎曲構(gòu)象和展平構(gòu)象之間,帽子結(jié)構(gòu)域處于向下位置,被稱為S2472E-Intermediate,代表中間開放構(gòu)象狀態(tài);第三類構(gòu)象的槳葉區(qū)被完全壓平,且帽子結(jié)構(gòu)處于向下位置,被稱為S2472E-Flattened,可能代表完全開放構(gòu)象狀態(tài),但該類別占比較低,分辨率難以提高。

研究者重點(diǎn)分析了S2472E-Intermediate構(gòu)象,其槳葉區(qū)部分展平,槳葉高度介于關(guān)閉態(tài)和失活態(tài)之間,胞外帽子發(fā)生旋轉(zhuǎn)且向下移動(dòng),進(jìn)而壓縮了下方相連的彈簧連接器,帽子門和疏水跨膜門被打開,胞內(nèi)側(cè)的杠桿結(jié)構(gòu)發(fā)生一定程度的彎折,然而此時(shí)側(cè)向門塞仍然保持堵塞。結(jié)合分子動(dòng)力學(xué)模擬,研究者認(rèn)為此構(gòu)象處于中間開放狀態(tài)(圖1中)。

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圖1 PIEZO1關(guān)閉、中間開放與失活的結(jié)構(gòu)機(jī)制示意圖


綜合對(duì)PIEZO1和PIEZO1-S2472E系列結(jié)構(gòu)的分析、突變和電生理學(xué)實(shí)驗(yàn)以及分子動(dòng)力學(xué)模擬等證據(jù),研究者定義了PIEZO1的關(guān)閉狀態(tài)、中間開放狀態(tài)和失活狀態(tài)的結(jié)構(gòu)特征,完善了PIEZO1的形變與曲率門控模型(圖2)。

A. PIEZO1-Curved和S2472E-Curved結(jié)構(gòu)代表PIEZO1的關(guān)閉狀態(tài),此時(shí)PIEZO1槳葉區(qū)呈高度彎曲狀,PIEZO1納米碗曲率半徑約為10-14nm,帽子在向上位置且全部門控位點(diǎn)關(guān)閉。

B. S2472E-Intermediate結(jié)構(gòu)代表PIEZO1的中間開放狀態(tài),此時(shí)帽子在向下位置且發(fā)生旋轉(zhuǎn),槳葉區(qū)部分下壓,曲率半徑約為32nm,杠桿結(jié)構(gòu)發(fā)生部分彎折,帽子門和跨膜門打開,離子能滲透通過中心孔道,但側(cè)塞門仍然保持關(guān)閉。

C. 在研究者預(yù)測(cè)的開放狀態(tài)S2472E-Flattened中,帽子仍處在向下位置,槳葉區(qū)徹底展平,包括側(cè)塞門在內(nèi)的所有門控位點(diǎn)全部打開。

D. PIEZO1-Flattened結(jié)構(gòu)代表PIEZO1的失活態(tài),此時(shí)槳葉區(qū)依舊保持展平,曲率半徑約為117nm,但帽子位于向上位置,彈簧連接器舒展,各個(gè)門控逐步關(guān)閉。

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圖2 PIEZO1的形變與曲率門控模型

致謝

肖百龍教授、李雪明研究員和田博學(xué)研究員為本研究的共同通訊作者,李雪明課題組已畢業(yè)學(xué)生劉斯嘉博士、肖百龍課題組已畢業(yè)學(xué)生楊旭中博士、肖百龍課題組在讀博士生陳旭東、田博學(xué)課題組在讀博士生張孝春和肖百龍課題組已畢業(yè)學(xué)生姜京徽博士為共同第一作者。另外,肖百龍課題組的原靜怡、劉文豪博士、王莉博士、吳坤博士和李雪明課題組的周珩博士也參與了部分工作。

本工作得到了國(guó)家科技部2030科技創(chuàng)新-“腦科學(xué)與類腦研究”重大項(xiàng)目(2021ZD0203301),國(guó)家自然科學(xué)基金委杰出青年科學(xué)基金以及延續(xù)資助(32425003、31825014)/重點(diǎn)項(xiàng)目(32130049)/創(chuàng)新研究群體項(xiàng)目(32021002),新基石研究員項(xiàng)目,北京市卓越學(xué)者項(xiàng)目,深圳市醫(yī)學(xué)研究專項(xiàng)(B2302016),清華大學(xué)萬科公共衛(wèi)生學(xué)院研究基金等項(xiàng)目的經(jīng)費(fèi)支持,以及清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心、北京結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心、膜生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、清華大學(xué)蛋白質(zhì)科學(xué)技術(shù)中心蛋白質(zhì)制備與鑒定實(shí)驗(yàn)室為本研究提供的經(jīng)費(fèi)或設(shè)施支持。


原文鏈接:https://www.cell.com/neuron/fulltext/S0896-6273(24)00877-8 

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